【背景と目的】静岡県浜松市にある佐鳴湖は，化学的酸素要求量（COD）の高い汽水湖として知られており，特殊な微生物生態系が存在することが示唆されてきた．我々は湖水の成分分析のために，孔径0.22 μmのメンブレンフィルターで湖水をろ過したところ，ろ液にフィルターを通過可能な微生物が存在した．そこで，これらの微生物の単離を試みたところ，フィルター通過可能な極小細菌として145株を単離することに成功した．得られた菌株の16S rRNA遺伝子配列を解読し，相同性検索を行った結果，5株（Ys株，RF111005株， M8-2株，M15株，M34株）については新規性の高い細菌であることが示唆された．そこで，我々はこの5株について，系統分類学的に同定して帰属を明らかにすることを目的とした．【方法】上記5株に対して形態学的性状，生理・生化学性状，化学分類性状，分子系統学的位置の4つの観点から以下実験・解析を行い，特徴付けを行った．まずグラム染色，2%リンタングステン酸によるnegative染色法を用いて透過型電子顕微鏡で観察し，形態学的性状を調べた．温度，pHに対する生育の可否，オキシダーゼ活性，カタラーゼ活性の評価を行うことで生理・生化学性状を調べた．化学分類性状については，キノンタイプと菌体内脂肪酸組成を，それぞれHPLCとMIDIシステムにて解析を行った．また，近隣結合法を用いて，16S rRNA遺伝子配列に基づく系統樹を作成し，分離株の分子系統学的な解析を行った．【結果と考察】5株はいずれもグラム陰性の好気性桿菌であった．また，5株の至適生育温度は30^oC（Ys, RF111005, M15，M34株）もしくは35^oC（M8-2株），Ys株を除く4株の至適生育pHは7.0 （RF111005株），7.5（M8-2，M15，M34株）であった．主要なキノンは，RF111005株を除く4株について， MK-6（M34株）またはMK-7（Ys，M8-2，M15株）であった．主要な脂肪酸はiso-C_15:0（Ys，RF111005，M8-2，M15株）またはiso-C_15:1 G（M34株）であったことから，各近縁種と同様であることが明らかとなった．また，16S rRNA遺伝子配列に基づく系統分類学的解析から，4株はBacteroidetes門のCytophagales目もしくはFlavobacteriales目に分類され，近縁種との相同性は92~94%であった．Deltaproteobacteria綱に分類されたRF111005株は，最も近縁な培養株（Geobacter grbiciae TACP-2^T株）との相同性が82%と非常に低かった．